Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2b4Q6Q477 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp2b4Q6Q477 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp2b4Q6Q477 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp2b4Q6Q477 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp2b4Q6Q477 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp2b4Q6Q477 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp2b4Q6Q477 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp2b4Q6Q477 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp2b4Q6Q477 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp2b4Q6Q477 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp2b4Q6Q477 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp2b4Q6Q477 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp2b4Q6Q477 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp2b4Q6Q477 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp2b4Q6Q477 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp2b4Q6Q477 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp2b4Q6Q477 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp2b4Q6Q477 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp2b4Q6Q477 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp2b4Q6Q477 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp2b4Q6Q477 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms