Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIX5

Rhbdf1, Inactive rhomboid protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdf1Q6PIX5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhbdf1Q6PIX5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhbdf1Q6PIX5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhbdf1Q6PIX5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhbdf1Q6PIX5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhbdf1Q6PIX5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhbdf1Q6PIX5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhbdf1Q6PIX5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhbdf1Q6PIX5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhbdf1Q6PIX5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhbdf1Q6PIX5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhbdf1Q6PIX5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhbdf1Q6PIX5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms