Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc57Q6PHN1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc57Q6PHN1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms