Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scaf4Q6PFF0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scaf4Q6PFF0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms