Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtifQ6PEE2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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