Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE54

Dhx40, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx40Q6PE54 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dhx40Q6PE54 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dhx40Q6PE54 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dhx40Q6PE54 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms