Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarcc2Q6PDG5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarcc2Q6PDG5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarcc2Q6PDG5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarcc2Q6PDG5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarcc2Q6PDG5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarcc2Q6PDG5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarcc2Q6PDG5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarcc2Q6PDG5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarcc2Q6PDG5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarcc2Q6PDG5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarcc2Q6PDG5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarcc2Q6PDG5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarcc2Q6PDG5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarcc2Q6PDG5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms