Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Slf2Q6P9P0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slf2Q6P9P0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Slf2Q6P9P0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Slf2Q6P9P0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Slf2Q6P9P0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Slf2Q6P9P0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slf2Q6P9P0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slf2Q6P9P0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slf2Q6P9P0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slf2Q6P9P0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slf2Q6P9P0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slf2Q6P9P0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slf2Q6P9P0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slf2Q6P9P0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slf2Q6P9P0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Slf2Q6P9P0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slf2Q6P9P0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slf2Q6P9P0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slf2Q6P9P0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slf2Q6P9P0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slf2Q6P9P0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slf2Q6P9P0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slf2Q6P9P0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slf2Q6P9P0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms