Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8W9

Hmgb4, High mobility group protein B4, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb4Q6P8W9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hmgb4Q6P8W9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.32■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hmgb4Q6P8W9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hmgb4Q6P8W9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms