Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Podnl1Q6P3Y9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Podnl1Q6P3Y9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Podnl1Q6P3Y9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Podnl1Q6P3Y9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Podnl1Q6P3Y9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Podnl1Q6P3Y9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Podnl1Q6P3Y9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Podnl1Q6P3Y9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Podnl1Q6P3Y9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Podnl1Q6P3Y9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Podnl1Q6P3Y9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Podnl1Q6P3Y9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Podnl1Q6P3Y9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Podnl1Q6P3Y9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Podnl1Q6P3Y9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Podnl1Q6P3Y9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Podnl1Q6P3Y9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Podnl1Q6P3Y9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Podnl1Q6P3Y9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms