Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ0

Ccdc189, Coiled-coil domain-containing protein 189, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc189Q6NZQ0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc189Q6NZQ0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc189Q6NZQ0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms