Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SphkapQ6NSW3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
SphkapQ6NSW3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SphkapQ6NSW3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SphkapQ6NSW3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SphkapQ6NSW3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SphkapQ6NSW3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SphkapQ6NSW3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SphkapQ6NSW3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SphkapQ6NSW3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SphkapQ6NSW3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SphkapQ6NSW3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SphkapQ6NSW3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SphkapQ6NSW3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SphkapQ6NSW3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SphkapQ6NSW3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SphkapQ6NSW3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SphkapQ6NSW3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SphkapQ6NSW3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SphkapQ6NSW3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SphkapQ6NSW3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SphkapQ6NSW3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SphkapQ6NSW3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SphkapQ6NSW3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SphkapQ6NSW3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SphkapQ6NSW3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SphkapQ6NSW3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
SphkapQ6NSW3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SphkapQ6NSW3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SphkapQ6NSW3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SphkapQ6NSW3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SphkapQ6NSW3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SphkapQ6NSW3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SphkapQ6NSW3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SphkapQ6NSW3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SphkapQ6NSW3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SphkapQ6NSW3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SphkapQ6NSW3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SphkapQ6NSW3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SphkapQ6NSW3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SphkapQ6NSW3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SphkapQ6NSW3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SphkapQ6NSW3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SphkapQ6NSW3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SphkapQ6NSW3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SphkapQ6NSW3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SphkapQ6NSW3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
SphkapQ6NSW3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SphkapQ6NSW3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SphkapQ6NSW3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SphkapQ6NSW3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SphkapQ6NSW3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SphkapQ6NSW3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SphkapQ6NSW3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SphkapQ6NSW3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SphkapQ6NSW3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SphkapQ6NSW3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SphkapQ6NSW3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms