Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMF0

Krt87, Keratin, type II cuticular 87, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt87Q6IMF0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt87Q6IMF0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt87Q6IMF0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt87Q6IMF0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt87Q6IMF0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt87Q6IMF0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt87Q6IMF0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt87Q6IMF0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt87Q6IMF0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt87Q6IMF0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt87Q6IMF0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt87Q6IMF0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt87Q6IMF0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt87Q6IMF0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt87Q6IMF0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt87Q6IMF0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt87Q6IMF0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt87Q6IMF0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt87Q6IMF0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt87Q6IMF0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt87Q6IMF0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt87Q6IMF0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt87Q6IMF0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt87Q6IMF0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt87Q6IMF0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt87Q6IMF0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt87Q6IMF0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt87Q6IMF0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt87Q6IMF0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt87Q6IMF0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt87Q6IMF0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt87Q6IMF0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt87Q6IMF0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt87Q6IMF0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt87Q6IMF0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt87Q6IMF0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt87Q6IMF0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt87Q6IMF0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt87Q6IMF0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt87Q6IMF0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms