Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt39Q6IFX4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt39Q6IFX4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt39Q6IFX4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms