Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nckap5lQ6GQX2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nckap5lQ6GQX2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nckap5lQ6GQX2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Nckap5lQ6GQX2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nckap5lQ6GQX2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nckap5lQ6GQX2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nckap5lQ6GQX2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nckap5lQ6GQX2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nckap5lQ6GQX2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nckap5lQ6GQX2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nckap5lQ6GQX2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nckap5lQ6GQX2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nckap5lQ6GQX2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms