Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Carmil1Q6EDY6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Carmil1Q6EDY6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Carmil1Q6EDY6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Carmil1Q6EDY6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Carmil1Q6EDY6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Carmil1Q6EDY6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Carmil1Q6EDY6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Carmil1Q6EDY6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Carmil1Q6EDY6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Carmil1Q6EDY6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Carmil1Q6EDY6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Carmil1Q6EDY6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Carmil1Q6EDY6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Carmil1Q6EDY6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Carmil1Q6EDY6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Carmil1Q6EDY6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Carmil1Q6EDY6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Carmil1Q6EDY6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Carmil1Q6EDY6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Carmil1Q6EDY6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Carmil1Q6EDY6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Carmil1Q6EDY6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Carmil1Q6EDY6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Carmil1Q6EDY6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Carmil1Q6EDY6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Carmil1Q6EDY6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Carmil1Q6EDY6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Carmil1Q6EDY6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Carmil1Q6EDY6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Carmil1Q6EDY6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
Carmil1Q6EDY6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Carmil1Q6EDY6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Carmil1Q6EDY6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Carmil1Q6EDY6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Carmil1Q6EDY6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Carmil1Q6EDY6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Carmil1Q6EDY6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Carmil1Q6EDY6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Carmil1Q6EDY6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Carmil1Q6EDY6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Carmil1Q6EDY6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Carmil1Q6EDY6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Carmil1Q6EDY6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Carmil1Q6EDY6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Carmil1Q6EDY6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Carmil1Q6EDY6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Carmil1Q6EDY6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Carmil1Q6EDY6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Carmil1Q6EDY6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Carmil1Q6EDY6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Carmil1Q6EDY6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Carmil1Q6EDY6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Carmil1Q6EDY6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Carmil1Q6EDY6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Carmil1Q6EDY6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Carmil1Q6EDY6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Carmil1Q6EDY6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms