Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg9bQ6EBV9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg9bQ6EBV9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms