Protein–RNA interactions for Protein: Q6A009

Ltn1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, mousemouse

Predictions only

Length 1,767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltn1Q6A009 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ltn1Q6A009 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ltn1Q6A009 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ltn1Q6A009 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ltn1Q6A009 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ltn1Q6A009 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ltn1Q6A009 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ltn1Q6A009 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ltn1Q6A009 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ltn1Q6A009 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ltn1Q6A009 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ltn1Q6A009 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ltn1Q6A009 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ltn1Q6A009 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ltn1Q6A009 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ltn1Q6A009 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ltn1Q6A009 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ltn1Q6A009 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ltn1Q6A009 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ltn1Q6A009 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ltn1Q6A009 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ltn1Q6A009 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ltn1Q6A009 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ltn1Q6A009 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ltn1Q6A009 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ltn1Q6A009 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ltn1Q6A009 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ltn1Q6A009 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ltn1Q6A009 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ltn1Q6A009 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ltn1Q6A009 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ltn1Q6A009 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ltn1Q6A009 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ltn1Q6A009 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ltn1Q6A009 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ltn1Q6A009 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ltn1Q6A009 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ltn1Q6A009 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ltn1Q6A009 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Ltn1Q6A009 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ltn1Q6A009 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ltn1Q6A009 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ltn1Q6A009 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ltn1Q6A009 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ltn1Q6A009 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ltn1Q6A009 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ltn1Q6A009 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ltn1Q6A009 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ltn1Q6A009 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ltn1Q6A009 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ltn1Q6A009 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ltn1Q6A009 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ltn1Q6A009 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ltn1Q6A009 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ltn1Q6A009 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ltn1Q6A009 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms