Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sptbn2Q68FG2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms