Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kiaa1549Q68FD9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kiaa1549Q68FD9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kiaa1549Q68FD9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kiaa1549Q68FD9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kiaa1549Q68FD9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kiaa1549Q68FD9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kiaa1549Q68FD9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Kiaa1549Q68FD9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kiaa1549Q68FD9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kiaa1549Q68FD9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kiaa1549Q68FD9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kiaa1549Q68FD9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kiaa1549Q68FD9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kiaa1549Q68FD9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kiaa1549Q68FD9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kiaa1549Q68FD9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kiaa1549Q68FD9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kiaa1549Q68FD9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kiaa1549Q68FD9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kiaa1549Q68FD9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kiaa1549Q68FD9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Kiaa1549Q68FD9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kiaa1549Q68FD9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kiaa1549Q68FD9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kiaa1549Q68FD9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kiaa1549Q68FD9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kiaa1549Q68FD9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kiaa1549Q68FD9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kiaa1549Q68FD9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kiaa1549Q68FD9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kiaa1549Q68FD9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kiaa1549Q68FD9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kiaa1549Q68FD9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kiaa1549Q68FD9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kiaa1549Q68FD9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kiaa1549Q68FD9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kiaa1549Q68FD9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kiaa1549Q68FD9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kiaa1549Q68FD9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kiaa1549Q68FD9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms