Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF8

Rapgefl1, Rap guanine nucleotide exchange factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgefl1Q68EF8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rapgefl1Q68EF8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rapgefl1Q68EF8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rapgefl1Q68EF8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rapgefl1Q68EF8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rapgefl1Q68EF8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rapgefl1Q68EF8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rapgefl1Q68EF8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rapgefl1Q68EF8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rapgefl1Q68EF8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rapgefl1Q68EF8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rapgefl1Q68EF8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rapgefl1Q68EF8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rapgefl1Q68EF8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rapgefl1Q68EF8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rapgefl1Q68EF8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rapgefl1Q68EF8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rapgefl1Q68EF8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rapgefl1Q68EF8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rapgefl1Q68EF8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rapgefl1Q68EF8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rapgefl1Q68EF8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rapgefl1Q68EF8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rapgefl1Q68EF8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rapgefl1Q68EF8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rapgefl1Q68EF8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rapgefl1Q68EF8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rapgefl1Q68EF8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rapgefl1Q68EF8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rapgefl1Q68EF8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rapgefl1Q68EF8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rapgefl1Q68EF8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rapgefl1Q68EF8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rapgefl1Q68EF8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rapgefl1Q68EF8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rapgefl1Q68EF8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rapgefl1Q68EF8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rapgefl1Q68EF8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rapgefl1Q68EF8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rapgefl1Q68EF8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rapgefl1Q68EF8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rapgefl1Q68EF8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rapgefl1Q68EF8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rapgefl1Q68EF8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rapgefl1Q68EF8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rapgefl1Q68EF8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rapgefl1Q68EF8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rapgefl1Q68EF8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rapgefl1Q68EF8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rapgefl1Q68EF8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rapgefl1Q68EF8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rapgefl1Q68EF8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rapgefl1Q68EF8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rapgefl1Q68EF8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rapgefl1Q68EF8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rapgefl1Q68EF8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rapgefl1Q68EF8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rapgefl1Q68EF8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rapgefl1Q68EF8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rapgefl1Q68EF8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rapgefl1Q68EF8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rapgefl1Q68EF8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rapgefl1Q68EF8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgefl1Q68EF8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms