Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrp4fQ66X05 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms