Protein–RNA interactions for Protein: Q64HY3

Sp9, Transcription factor Sp9, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp9Q64HY3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sp9Q64HY3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sp9Q64HY3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sp9Q64HY3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Sp9Q64HY3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
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Sp9Q64HY3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Sp9Q64HY3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sp9Q64HY3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Sp9Q64HY3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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Sp9Q64HY3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sp9Q64HY3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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Sp9Q64HY3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp9Q64HY3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Sp9Q64HY3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp9Q64HY3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp9Q64HY3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp9Q64HY3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp9Q64HY3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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Sp9Q64HY3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sp9Q64HY3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sp9Q64HY3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Sp9Q64HY3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sp9Q64HY3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sp9Q64HY3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Sp9Q64HY3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sp9Q64HY3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sp9Q64HY3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sp9Q64HY3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sp9Q64HY3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sp9Q64HY3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Sp9Q64HY3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sp9Q64HY3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Sp9Q64HY3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp9Q64HY3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp9Q64HY3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Sp9Q64HY3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Sp9Q64HY3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Sp9Q64HY3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sp9Q64HY3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Sp9Q64HY3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sp9Q64HY3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Sp9Q64HY3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sp9Q64HY3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sp9Q64HY3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sp9Q64HY3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sp9Q64HY3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sp9Q64HY3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sp9Q64HY3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sp9Q64HY3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sp9Q64HY3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sp9Q64HY3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sp9Q64HY3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sp9Q64HY3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sp9Q64HY3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sp9Q64HY3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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