Protein–RNA interactions for Protein: Q64524

Hist2h2be, Histone H2B type 2-E, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2beQ64524 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hist2h2beQ64524 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms