Protein–RNA interactions for Protein: Q64459

Cyp3a11, Cytochrome P450 3A11, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a11Q64459 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp3a11Q64459 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp3a11Q64459 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp3a11Q64459 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp3a11Q64459 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp3a11Q64459 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp3a11Q64459 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp3a11Q64459 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp3a11Q64459 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp3a11Q64459 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp3a11Q64459 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp3a11Q64459 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp3a11Q64459 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp3a11Q64459 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp3a11Q64459 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp3a11Q64459 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp3a11Q64459 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp3a11Q64459 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp3a11Q64459 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp3a11Q64459 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp3a11Q64459 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp3a11Q64459 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp3a11Q64459 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp3a11Q64459 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp3a11Q64459 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp3a11Q64459 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp3a11Q64459 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp3a11Q64459 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp3a11Q64459 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp3a11Q64459 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp3a11Q64459 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp3a11Q64459 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp3a11Q64459 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp3a11Q64459 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyp3a11Q64459 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyp3a11Q64459 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyp3a11Q64459 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp3a11Q64459 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cyp3a11Q64459 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cyp3a11Q64459 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp3a11Q64459 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp3a11Q64459 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp3a11Q64459 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp3a11Q64459 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp3a11Q64459 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp3a11Q64459 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp3a11Q64459 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp3a11Q64459 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp3a11Q64459 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp3a11Q64459 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp3a11Q64459 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp3a11Q64459 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp3a11Q64459 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms