Protein–RNA interactions for Protein: Q64221

Nhlh2, Helix-loop-helix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh2Q64221 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlh2Q64221 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nhlh2Q64221 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms