Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Polr2kQ63871 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr2kQ63871 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms