Protein–RNA interactions for Protein: Q62371

Ddr2, Discoidin domain-containing receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr2Q62371 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddr2Q62371 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ddr2Q62371 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddr2Q62371 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms