Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SypQ62277 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SypQ62277 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SypQ62277 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SypQ62277 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SypQ62277 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SypQ62277 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SypQ62277 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SypQ62277 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SypQ62277 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SypQ62277 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SypQ62277 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SypQ62277 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SypQ62277 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SypQ62277 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SypQ62277 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SypQ62277 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SypQ62277 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SypQ62277 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SypQ62277 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SypQ62277 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SypQ62277 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SypQ62277 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SypQ62277 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SypQ62277 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SypQ62277 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SypQ62277 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SypQ62277 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SypQ62277 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SypQ62277 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SypQ62277 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SypQ62277 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SypQ62277 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SypQ62277 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SypQ62277 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SypQ62277 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SypQ62277 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SypQ62277 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SypQ62277 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SypQ62277 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SypQ62277 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SypQ62277 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SypQ62277 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SypQ62277 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SypQ62277 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SypQ62277 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SypQ62277 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SypQ62277 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SypQ62277 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SypQ62277 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SypQ62277 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SypQ62277 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SypQ62277 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SypQ62277 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SypQ62277 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SypQ62277 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SypQ62277 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SypQ62277 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SypQ62277 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SypQ62277 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SypQ62277 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SypQ62277 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SypQ62277 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SypQ62277 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SypQ62277 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SypQ62277 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SypQ62277 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SypQ62277 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SypQ62277 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SypQ62277 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SypQ62277 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SypQ62277 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SypQ62277 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SypQ62277 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SypQ62277 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SypQ62277 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SypQ62277 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SypQ62277 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SypQ62277 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SypQ62277 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SypQ62277 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SypQ62277 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SypQ62277 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SypQ62277 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SypQ62277 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SypQ62277 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SypQ62277 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SypQ62277 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SypQ62277 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SypQ62277 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SypQ62277 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SypQ62277 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SypQ62277 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SypQ62277 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SypQ62277 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SypQ62277 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SypQ62277 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SypQ62277 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SypQ62277 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SypQ62277 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms