Protein–RNA interactions for Protein: Q62232

Six2, Homeobox protein SIX2, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six2Q62232 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Six2Q62232 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Six2Q62232 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Six2Q62232 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Six2Q62232 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Six2Q62232 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Six2Q62232 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Six2Q62232 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Six2Q62232 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Six2Q62232 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Six2Q62232 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Six2Q62232 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Six2Q62232 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Six2Q62232 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Six2Q62232 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Six2Q62232 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Six2Q62232 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Six2Q62232 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Six2Q62232 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Six2Q62232 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Six2Q62232 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Six2Q62232 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Six2Q62232 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Six2Q62232 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Six2Q62232 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Six2Q62232 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Six2Q62232 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Six2Q62232 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Six2Q62232 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Six2Q62232 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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