Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sycp1Q62209 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Sycp1Q62209 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sycp1Q62209 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms