Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RhocQ62159 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RhocQ62159 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RhocQ62159 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RhocQ62159 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RhocQ62159 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RhocQ62159 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RhocQ62159 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RhocQ62159 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RhocQ62159 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RhocQ62159 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RhocQ62159 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RhocQ62159 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RhocQ62159 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RhocQ62159 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RhocQ62159 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RhocQ62159 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RhocQ62159 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RhocQ62159 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RhocQ62159 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RhocQ62159 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RhocQ62159 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RhocQ62159 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhocQ62159 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhocQ62159 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhocQ62159 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhocQ62159 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhocQ62159 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhocQ62159 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhocQ62159 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhocQ62159 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhocQ62159 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhocQ62159 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RhocQ62159 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhocQ62159 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhocQ62159 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhocQ62159 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhocQ62159 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RhocQ62159 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RhocQ62159 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RhocQ62159 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RhocQ62159 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RhocQ62159 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RhocQ62159 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RhocQ62159 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RhocQ62159 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RhocQ62159 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RhocQ62159 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RhocQ62159 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RhocQ62159 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RhocQ62159 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms