Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim27Q62158 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim27Q62158 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms