Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phox2aQ62066 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phox2aQ62066 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms