Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EsrrbQ61539 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EsrrbQ61539 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms