Protein–RNA interactions for Protein: Q61496

Ddx4, ATP-dependent RNA helicase DDX4, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx4Q61496 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
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Ddx4Q61496 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx4Q61496 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx4Q61496 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx4Q61496 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx4Q61496 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx4Q61496 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
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Ddx4Q61496 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx4Q61496 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx4Q61496 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx4Q61496 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx4Q61496 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx4Q61496 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
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Ddx4Q61496 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
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Ddx4Q61496 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx4Q61496 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx4Q61496 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx4Q61496 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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Ddx4Q61496 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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Ddx4Q61496 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx4Q61496 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx4Q61496 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx4Q61496 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx4Q61496 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx4Q61496 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx4Q61496 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
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Ddx4Q61496 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx4Q61496 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx4Q61496 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx4Q61496 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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Ddx4Q61496 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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Ddx4Q61496 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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Ddx4Q61496 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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Ddx4Q61496 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
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Ddx4Q61496 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
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