Protein–RNA interactions for Protein: Q61490

Alcam, CD166 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlcamQ61490 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AlcamQ61490 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms