Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc9a1Q61165 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc9a1Q61165 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc9a1Q61165 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc9a1Q61165 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc9a1Q61165 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc9a1Q61165 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc9a1Q61165 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc9a1Q61165 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc9a1Q61165 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc9a1Q61165 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc9a1Q61165 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc9a1Q61165 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc9a1Q61165 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc9a1Q61165 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc9a1Q61165 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc9a1Q61165 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms