Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpc6Q61143 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc6Q61143 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms