Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NinQ61043 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NinQ61043 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NinQ61043 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NinQ61043 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NinQ61043 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NinQ61043 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NinQ61043 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NinQ61043 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NinQ61043 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NinQ61043 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NinQ61043 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NinQ61043 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NinQ61043 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NinQ61043 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NinQ61043 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NinQ61043 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NinQ61043 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NinQ61043 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NinQ61043 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NinQ61043 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NinQ61043 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NinQ61043 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NinQ61043 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NinQ61043 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NinQ61043 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NinQ61043 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NinQ61043 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NinQ61043 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NinQ61043 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NinQ61043 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NinQ61043 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NinQ61043 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NinQ61043 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NinQ61043 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NinQ61043 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NinQ61043 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NinQ61043 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NinQ61043 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NinQ61043 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NinQ61043 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NinQ61043 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NinQ61043 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NinQ61043 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NinQ61043 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NinQ61043 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NinQ61043 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NinQ61043 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NinQ61043 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NinQ61043 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NinQ61043 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NinQ61043 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NinQ61043 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NinQ61043 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NinQ61043 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NinQ61043 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NinQ61043 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NinQ61043 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NinQ61043 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NinQ61043 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NinQ61043 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NinQ61043 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NinQ61043 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NinQ61043 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NinQ61043 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NinQ61043 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NinQ61043 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NinQ61043 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NinQ61043 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NinQ61043 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NinQ61043 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NinQ61043 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NinQ61043 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NinQ61043 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NinQ61043 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NinQ61043 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NinQ61043 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NinQ61043 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NinQ61043 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NinQ61043 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NinQ61043 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NinQ61043 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NinQ61043 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NinQ61043 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NinQ61043 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NinQ61043 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NinQ61043 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NinQ61043 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NinQ61043 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NinQ61043 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NinQ61043 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NinQ61043 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NinQ61043 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NinQ61043 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NinQ61043 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NinQ61043 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NinQ61043 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NinQ61043 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NinQ61043 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NinQ61043 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms