Protein–RNA interactions for Protein: Q60932

Vdac1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac1Q60932 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vdac1Q60932 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms