Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SkiQ60698 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SkiQ60698 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SkiQ60698 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SkiQ60698 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SkiQ60698 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SkiQ60698 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SkiQ60698 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SkiQ60698 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SkiQ60698 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SkiQ60698 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SkiQ60698 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SkiQ60698 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SkiQ60698 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SkiQ60698 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SkiQ60698 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SkiQ60698 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SkiQ60698 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SkiQ60698 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SkiQ60698 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SkiQ60698 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SkiQ60698 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SkiQ60698 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SkiQ60698 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SkiQ60698 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SkiQ60698 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SkiQ60698 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SkiQ60698 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SkiQ60698 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SkiQ60698 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SkiQ60698 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SkiQ60698 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SkiQ60698 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SkiQ60698 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SkiQ60698 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SkiQ60698 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SkiQ60698 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SkiQ60698 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SkiQ60698 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SkiQ60698 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SkiQ60698 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SkiQ60698 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SkiQ60698 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SkiQ60698 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SkiQ60698 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SkiQ60698 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SkiQ60698 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SkiQ60698 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms