Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ClpbQ60649 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ClpbQ60649 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ClpbQ60649 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ClpbQ60649 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ClpbQ60649 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ClpbQ60649 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ClpbQ60649 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ClpbQ60649 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ClpbQ60649 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ClpbQ60649 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ClpbQ60649 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ClpbQ60649 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ClpbQ60649 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ClpbQ60649 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ClpbQ60649 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ClpbQ60649 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ClpbQ60649 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ClpbQ60649 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ClpbQ60649 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ClpbQ60649 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ClpbQ60649 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ClpbQ60649 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ClpbQ60649 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ClpbQ60649 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ClpbQ60649 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ClpbQ60649 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ClpbQ60649 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ClpbQ60649 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ClpbQ60649 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ClpbQ60649 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ClpbQ60649 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ClpbQ60649 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ClpbQ60649 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ClpbQ60649 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ClpbQ60649 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ClpbQ60649 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ClpbQ60649 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ClpbQ60649 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ClpbQ60649 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ClpbQ60649 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms