Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp13a3Q5XF89 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp13a3Q5XF89 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp13a3Q5XF89 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms