Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIS6

Noto, Homeobox protein notochord, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NotoQ5TIS6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NotoQ5TIS6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NotoQ5TIS6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 503.6 ms