Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tsr1Q5SWD9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tsr1Q5SWD9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsr1Q5SWD9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms