Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc42Q5SV66 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms