Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH7

Zzef1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzef1Q5SSH7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Zzef1Q5SSH7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zzef1Q5SSH7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zzef1Q5SSH7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zzef1Q5SSH7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zzef1Q5SSH7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zzef1Q5SSH7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zzef1Q5SSH7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zzef1Q5SSH7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zzef1Q5SSH7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zzef1Q5SSH7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zzef1Q5SSH7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Zzef1Q5SSH7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zzef1Q5SSH7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zzef1Q5SSH7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zzef1Q5SSH7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zzef1Q5SSH7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zzef1Q5SSH7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms