Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQK8

4930512M02Rik, RIKEN cDNA 4930512M02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930512M02RikQ5SQK8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
4930512M02RikQ5SQK8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930512M02RikQ5SQK8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms