Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps54Q5SPW0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps54Q5SPW0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps54Q5SPW0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps54Q5SPW0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps54Q5SPW0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps54Q5SPW0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps54Q5SPW0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps54Q5SPW0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps54Q5SPW0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps54Q5SPW0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps54Q5SPW0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps54Q5SPW0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps54Q5SPW0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps54Q5SPW0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps54Q5SPW0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps54Q5SPW0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps54Q5SPW0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps54Q5SPW0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps54Q5SPW0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps54Q5SPW0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps54Q5SPW0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps54Q5SPW0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps54Q5SPW0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps54Q5SPW0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps54Q5SPW0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps54Q5SPW0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps54Q5SPW0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps54Q5SPW0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps54Q5SPW0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps54Q5SPW0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps54Q5SPW0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps54Q5SPW0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps54Q5SPW0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps54Q5SPW0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps54Q5SPW0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps54Q5SPW0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps54Q5SPW0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps54Q5SPW0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps54Q5SPW0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms